第二季延续了第一季的悬疑氛围。那座废弃的“雾谷站”每隔十年就会出现一次，载着迷途的灵魂驶向未知。这一季，主角林沐风为了寻找在第一季末消失的恋人，主动踏入了列车。他在不同的车厢遇到了不同的“乘客”——每个乘客都是一个未完成的心愿，而列车长则是一个知晓所有秘密的神秘小女孩。林沐风必须在列车抵达终点“忘却之渊”前找到答案。
神秘的小女孩列车长要求林沐风陪她玩“找不同”游戏。他在两幅几乎一样的车站旧照中，发现了关键线索——照片里售票窗口后面，站着第一季消失的恋人，她穿着列车员的制服，对着镜头在微笑。
林沐风遇到一个在车上坐了五十年的老人。老人每天都会在“过去站”下车，却总在车门关闭前又跳回来，因为那个站台上等他的妻子，他不敢面对她已经不在的事实。林沐风帮他递出了一封跨越时间的信。
林沐风进入一面镜子里的车厢，这里的时间是倒流的。他看到了恋人与他初遇时的场景，而恋人似乎也隔着镜子看到了他，对他轻轻摇头，示意他不要再往前走了。林沐风却更加坚定了继续前进的决心。
林沐风在车厢座位下捡到一把破旧的雨伞。触碰伞柄的瞬间，他“听”到恋人喃喃自语：“这把伞，他忘记带走了。”那是他们第一次约会时他留下的伞，原来她一直保留着，就像保留着所有关于他的回忆。
列车突然开始循环经过同一个站台“起点站”。林沐风跳下车，发现这里其实是第一季结尾他送走恋人的地方。他明白了，这趟列车在等他做出选择：是回到过去，还是走向未来。
雾谷站再次现世，林沐风毫不犹豫地踏入车站。不同于第一季的阴森，这次的车站亮着温暖的黄灯，仿佛在欢迎他回家。列车轰鸣着进站，车门上倒映出他孤独而坚定的影子。